生态龟缸在冬天可以正常运行，尤其是在南方地区。关键在于使用大水体（如60长30高的周转箱），底部铺设大量火山石吸附粪便并培养硝化细菌，溪流石防止乌龟应激和搅起粪便。冬季需使用恒温加热棒保持水温稳定，避免植物受损。选择四季常青的植物如春羽和水竹，并用篮子种植以防破坏。喂食时选用膨化技术好的龟粮，减少水质浑浊和油膜。添加细菌屋和水生植物如水芙蓉、水葫芦，增强净水效果。这些措施确保生态龟缸全年运行良好，水质清澈无异味。